Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IST1P53990 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IST1P53990 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IST1P53990 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IST1P53990 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IST1P53990 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IST1P53990 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IST1P53990 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IST1P53990 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IST1P53990 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IST1P53990 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IST1P53990 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IST1P53990 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IST1P53990 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IST1P53990 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IST1P53990 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IST1P53990 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IST1P53990 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IST1P53990 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IST1P53990 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IST1P53990 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IST1P53990 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IST1P53990 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IST1P53990 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IST1P53990 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IST1P53990 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IST1P53990 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IST1P53990 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IST1P53990 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IST1P53990 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IST1P53990 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IST1P53990 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IST1P53990 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IST1P53990 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IST1P53990 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IST1P53990 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IST1P53990 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IST1P53990 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IST1P53990 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IST1P53990 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IST1P53990 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IST1P53990 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IST1P53990 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IST1P53990 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IST1P53990 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IST1P53990 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IST1P53990 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IST1P53990 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IST1P53990 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IST1P53990 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IST1P53990 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IST1P53990 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IST1P53990 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IST1P53990 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IST1P53990 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IST1P53990 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IST1P53990 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IST1P53990 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IST1P53990 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IST1P53990 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IST1P53990 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IST1P53990 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IST1P53990 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IST1P53990 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IST1P53990 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IST1P53990 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IST1P53990 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IST1P53990 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IST1P53990 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IST1P53990 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IST1P53990 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IST1P53990 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IST1P53990 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IST1P53990 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IST1P53990 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IST1P53990 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IST1P53990 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IST1P53990 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IST1P53990 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IST1P53990 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IST1P53990 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IST1P53990 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IST1P53990 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IST1P53990 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IST1P53990 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IST1P53990 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IST1P53990 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IST1P53990 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IST1P53990 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IST1P53990 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IST1P53990 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IST1P53990 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IST1P53990 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IST1P53990 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IST1P53990 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IST1P53990 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IST1P53990 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IST1P53990 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IST1P53990 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IST1P53990 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms