Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLA2G16P53816 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PLA2G16P53816 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLA2G16P53816 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLA2G16P53816 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLA2G16P53816 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PLA2G16P53816 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms