Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2KP53803 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
POLR2KP53803 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2KP53803 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR2KP53803 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms