Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2S1P53680 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP2S1P53680 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP2S1P53680 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP2S1P53680 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP2S1P53680 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms