Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUCLG1P53597 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUCLG1P53597 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUCLG1P53597 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUCLG1P53597 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUCLG1P53597 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SUCLG1P53597 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms