Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBX2P52951 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX2P52951 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX2P52951 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX2P52951 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX2P52951 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GBX2P52951 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX2P52951 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX2P52951 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBX2P52951 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX2P52951 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX2P52951 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GBX2P52951 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX2P52951 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GBX2P52951 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GBX2P52951 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GBX2P52951 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX2P52951 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX2P52951 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX2P52951 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GBX2P52951 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GBX2P52951 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX2P52951 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX2P52951 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GBX2P52951 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX2P52951 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX2P52951 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX2P52951 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX2P52951 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBX2P52951 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX2P52951 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBX2P52951 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX2P52951 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX2P52951 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX2P52951 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBX2P52951 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBX2P52951 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GBX2P52951 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX2P52951 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX2P52951 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX2P52951 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBX2P52951 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX2P52951 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX2P52951 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX2P52951 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBX2P52951 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX2P52951 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX2P52951 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX2P52951 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBX2P52951 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX2P52951 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX2P52951 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX2P52951 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBX2P52951 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBX2P52951 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX2P52951 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX2P52951 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX2P52951 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBX2P52951 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBX2P52951 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBX2P52951 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBX2P52951 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBX2P52951 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBX2P52951 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX2P52951 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX2P52951 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBX2P52951 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBX2P52951 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX2P52951 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX2P52951 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GBX2P52951 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX2P52951 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX2P52951 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX2P52951 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBX2P52951 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBX2P52951 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBX2P52951 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX2P52951 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX2P52951 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX2P52951 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBX2P52951 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX2P52951 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX2P52951 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX2P52951 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX2P52951 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBX2P52951 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX2P52951 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX2P52951 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX2P52951 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX2P52951 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBX2P52951 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX2P52951 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX2P52951 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX2P52951 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX2P52951 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX2P52951 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GBX2P52951 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX2P52951 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBX2P52951 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBX2P52951 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms