Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KPNA1P52294 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA1P52294 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA1P52294 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA1P52294 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA1P52294 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KPNA1P52294 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KPNA1P52294 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KPNA1P52294 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KPNA1P52294 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA1P52294 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KPNA1P52294 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KPNA1P52294 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA1P52294 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KPNA1P52294 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KPNA1P52294 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KPNA1P52294 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KPNA1P52294 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KPNA1P52294 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KPNA1P52294 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KPNA1P52294 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms