Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
KPNA2P52292 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KPNA2P52292 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KPNA2P52292 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KPNA2P52292 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KPNA2P52292 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KPNA2P52292 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms