Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LUMP51884 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LUMP51884 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LUMP51884 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LUMP51884 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LUMP51884 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LUMP51884 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LUMP51884 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LUMP51884 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LUMP51884 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LUMP51884 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LUMP51884 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LUMP51884 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LUMP51884 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LUMP51884 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LUMP51884 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LUMP51884 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LUMP51884 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LUMP51884 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LUMP51884 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LUMP51884 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LUMP51884 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LUMP51884 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LUMP51884 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LUMP51884 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LUMP51884 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LUMP51884 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LUMP51884 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LUMP51884 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LUMP51884 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LUMP51884 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LUMP51884 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LUMP51884 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LUMP51884 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LUMP51884 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LUMP51884 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LUMP51884 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LUMP51884 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LUMP51884 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LUMP51884 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LUMP51884 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LUMP51884 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LUMP51884 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LUMP51884 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LUMP51884 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LUMP51884 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LUMP51884 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LUMP51884 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LUMP51884 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LUMP51884 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LUMP51884 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LUMP51884 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LUMP51884 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LUMP51884 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LUMP51884 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LUMP51884 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LUMP51884 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LUMP51884 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LUMP51884 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LUMP51884 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LUMP51884 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LUMP51884 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LUMP51884 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LUMP51884 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LUMP51884 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LUMP51884 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LUMP51884 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LUMP51884 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LUMP51884 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LUMP51884 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LUMP51884 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LUMP51884 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LUMP51884 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LUMP51884 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LUMP51884 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LUMP51884 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LUMP51884 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LUMP51884 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LUMP51884 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LUMP51884 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LUMP51884 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LUMP51884 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LUMP51884 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LUMP51884 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LUMP51884 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LUMP51884 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LUMP51884 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LUMP51884 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LUMP51884 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LUMP51884 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LUMP51884 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LUMP51884 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LUMP51884 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LUMP51884 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LUMP51884 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LUMP51884 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LUMP51884 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LUMP51884 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LUMP51884 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LUMP51884 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms