Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK1P49759 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK1P49759 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK1P49759 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK1P49759 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK1P49759 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK1P49759 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK1P49759 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK1P49759 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK1P49759 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK1P49759 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK1P49759 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK1P49759 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK1P49759 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK1P49759 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK1P49759 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK1P49759 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK1P49759 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK1P49759 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK1P49759 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK1P49759 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK1P49759 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK1P49759 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK1P49759 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK1P49759 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK1P49759 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK1P49759 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK1P49759 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK1P49759 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK1P49759 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK1P49759 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLK1P49759 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK1P49759 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK1P49759 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK1P49759 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLK1P49759 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK1P49759 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK1P49759 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK1P49759 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLK1P49759 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK1P49759 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK1P49759 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK1P49759 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLK1P49759 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK1P49759 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK1P49759 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK1P49759 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK1P49759 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLK1P49759 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK1P49759 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLK1P49759 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK1P49759 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK1P49759 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK1P49759 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK1P49759 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK1P49759 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLK1P49759 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK1P49759 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK1P49759 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK1P49759 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK1P49759 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK1P49759 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK1P49759 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLK1P49759 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK1P49759 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK1P49759 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLK1P49759 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK1P49759 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK1P49759 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK1P49759 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK1P49759 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLK1P49759 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK1P49759 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK1P49759 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK1P49759 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK1P49759 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLK1P49759 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK1P49759 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK1P49759 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK1P49759 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK1P49759 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK1P49759 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK1P49759 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK1P49759 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK1P49759 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK1P49759 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK1P49759 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK1P49759 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK1P49759 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK1P49759 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK1P49759 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK1P49759 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK1P49759 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK1P49759 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK1P49759 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK1P49759 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK1P49759 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK1P49759 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK1P49759 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK1P49759 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms