Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC34P49427 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC34P49427 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC34P49427 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC34P49427 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC34P49427 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC34P49427 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC34P49427 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC34P49427 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC34P49427 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC34P49427 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC34P49427 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDC34P49427 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC34P49427 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC34P49427 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC34P49427 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC34P49427 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDC34P49427 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC34P49427 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC34P49427 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDC34P49427 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC34P49427 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC34P49427 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDC34P49427 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC34P49427 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC34P49427 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC34P49427 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC34P49427 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC34P49427 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC34P49427 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC34P49427 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC34P49427 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC34P49427 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC34P49427 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC34P49427 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC34P49427 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC34P49427 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC34P49427 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC34P49427 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC34P49427 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC34P49427 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC34P49427 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC34P49427 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC34P49427 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC34P49427 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC34P49427 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC34P49427 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDC34P49427 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDC34P49427 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC34P49427 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC34P49427 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC34P49427 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC34P49427 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDC34P49427 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC34P49427 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC34P49427 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC34P49427 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC34P49427 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDC34P49427 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC34P49427 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC34P49427 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC34P49427 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC34P49427 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDC34P49427 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC34P49427 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC34P49427 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC34P49427 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDC34P49427 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDC34P49427 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDC34P49427 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC34P49427 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC34P49427 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC34P49427 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC34P49427 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC34P49427 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC34P49427 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDC34P49427 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDC34P49427 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC34P49427 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC34P49427 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC34P49427 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDC34P49427 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC34P49427 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC34P49427 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDC34P49427 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC34P49427 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC34P49427 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDC34P49427 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC34P49427 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC34P49427 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC34P49427 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDC34P49427 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDC34P49427 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC34P49427 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC34P49427 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC34P49427 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC34P49427 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC34P49427 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC34P49427 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC34P49427 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms