Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNTBP49356 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNTBP49356 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNTBP49356 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNTBP49356 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNTBP49356 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FNTBP49356 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FNTBP49356 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FNTBP49356 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FNTBP49356 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FNTBP49356 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNTBP49356 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FNTBP49356 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FNTBP49356 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FNTBP49356 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FNTBP49356 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNTBP49356 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNTBP49356 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNTBP49356 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FNTBP49356 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTBP49356 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTBP49356 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTBP49356 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FNTBP49356 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FNTBP49356 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTBP49356 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTBP49356 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTBP49356 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTBP49356 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTBP49356 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FNTBP49356 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FNTBP49356 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FNTBP49356 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FNTBP49356 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FNTBP49356 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FNTBP49356 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FNTBP49356 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTBP49356 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTBP49356 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTBP49356 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FNTBP49356 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FNTBP49356 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FNTBP49356 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNTBP49356 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FNTBP49356 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNTBP49356 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNTBP49356 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNTBP49356 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FNTBP49356 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FNTBP49356 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FNTBP49356 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNTBP49356 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNTBP49356 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNTBP49356 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FNTBP49356 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNTBP49356 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNTBP49356 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FNTBP49356 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FNTBP49356 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FNTBP49356 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FNTBP49356 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNTBP49356 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNTBP49356 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FNTBP49356 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTBP49356 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTBP49356 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTBP49356 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FNTBP49356 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNTBP49356 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNTBP49356 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FNTBP49356 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FNTBP49356 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FNTBP49356 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNTBP49356 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNTBP49356 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNTBP49356 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FNTBP49356 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FNTBP49356 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNTBP49356 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNTBP49356 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNTBP49356 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNTBP49356 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FNTBP49356 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FNTBP49356 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNTBP49356 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNTBP49356 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTBP49356 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTBP49356 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNTBP49356 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNTBP49356 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNTBP49356 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms