Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD97P48960 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD97P48960 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD97P48960 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD97P48960 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD97P48960 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CD97P48960 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD97P48960 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD97P48960 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD97P48960 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD97P48960 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD97P48960 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD97P48960 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD97P48960 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD97P48960 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD97P48960 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD97P48960 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD97P48960 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD97P48960 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD97P48960 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD97P48960 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD97P48960 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD97P48960 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD97P48960 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD97P48960 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD97P48960 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CD97P48960 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD97P48960 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD97P48960 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD97P48960 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD97P48960 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD97P48960 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD97P48960 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD97P48960 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD97P48960 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD97P48960 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD97P48960 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD97P48960 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD97P48960 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD97P48960 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD97P48960 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD97P48960 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD97P48960 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD97P48960 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD97P48960 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD97P48960 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD97P48960 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD97P48960 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD97P48960 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD97P48960 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD97P48960 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD97P48960 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD97P48960 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD97P48960 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD97P48960 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD97P48960 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD97P48960 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD97P48960 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD97P48960 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD97P48960 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD97P48960 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD97P48960 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD97P48960 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD97P48960 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD97P48960 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD97P48960 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD97P48960 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD97P48960 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD97P48960 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD97P48960 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD97P48960 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD97P48960 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD97P48960 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD97P48960 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CD97P48960 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD97P48960 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CD97P48960 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD97P48960 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD97P48960 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD97P48960 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD97P48960 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD97P48960 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD97P48960 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD97P48960 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD97P48960 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD97P48960 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD97P48960 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD97P48960 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD97P48960 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CD97P48960 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD97P48960 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD97P48960 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD97P48960 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD97P48960 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD97P48960 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD97P48960 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CD97P48960 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD97P48960 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD97P48960 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CD97P48960 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms