Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT6CP48668 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT6CP48668 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT6CP48668 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT6CP48668 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT6CP48668 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT6CP48668 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms