Protein–RNA interactions for Protein: P48549

KCNJ3, G protein-activated inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ3P48549 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNJ3P48549 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNJ3P48549 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNJ3P48549 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNJ3P48549 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNJ3P48549 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNJ3P48549 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms