Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCP4P48539 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCP4P48539 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCP4P48539 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCP4P48539 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCP4P48539 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCP4P48539 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCP4P48539 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCP4P48539 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCP4P48539 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCP4P48539 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCP4P48539 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCP4P48539 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCP4P48539 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCP4P48539 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCP4P48539 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCP4P48539 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCP4P48539 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCP4P48539 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCP4P48539 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCP4P48539 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCP4P48539 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCP4P48539 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCP4P48539 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCP4P48539 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCP4P48539 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCP4P48539 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCP4P48539 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCP4P48539 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCP4P48539 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCP4P48539 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCP4P48539 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCP4P48539 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCP4P48539 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCP4P48539 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCP4P48539 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCP4P48539 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCP4P48539 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCP4P48539 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCP4P48539 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCP4P48539 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCP4P48539 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCP4P48539 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCP4P48539 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCP4P48539 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCP4P48539 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCP4P48539 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCP4P48539 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PCP4P48539 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PCP4P48539 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PCP4P48539 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCP4P48539 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCP4P48539 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCP4P48539 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCP4P48539 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCP4P48539 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCP4P48539 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCP4P48539 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCP4P48539 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCP4P48539 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCP4P48539 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCP4P48539 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCP4P48539 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCP4P48539 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCP4P48539 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCP4P48539 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCP4P48539 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCP4P48539 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCP4P48539 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PCP4P48539 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PCP4P48539 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCP4P48539 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PCP4P48539 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCP4P48539 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCP4P48539 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCP4P48539 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCP4P48539 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCP4P48539 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCP4P48539 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCP4P48539 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCP4P48539 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCP4P48539 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCP4P48539 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCP4P48539 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCP4P48539 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCP4P48539 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCP4P48539 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCP4P48539 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCP4P48539 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCP4P48539 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCP4P48539 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCP4P48539 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCP4P48539 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCP4P48539 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCP4P48539 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCP4P48539 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCP4P48539 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCP4P48539 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCP4P48539 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCP4P48539 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms