Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REG1BP48304 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REG1BP48304 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REG1BP48304 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REG1BP48304 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REG1BP48304 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REG1BP48304 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REG1BP48304 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REG1BP48304 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
REG1BP48304 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
REG1BP48304 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REG1BP48304 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
REG1BP48304 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REG1BP48304 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
REG1BP48304 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
REG1BP48304 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
REG1BP48304 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REG1BP48304 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REG1BP48304 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REG1BP48304 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REG1BP48304 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REG1BP48304 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REG1BP48304 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
REG1BP48304 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
REG1BP48304 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REG1BP48304 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
REG1BP48304 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REG1BP48304 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
REG1BP48304 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
REG1BP48304 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
REG1BP48304 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
REG1BP48304 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
REG1BP48304 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
REG1BP48304 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
REG1BP48304 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REG1BP48304 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
REG1BP48304 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
REG1BP48304 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
REG1BP48304 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REG1BP48304 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REG1BP48304 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
REG1BP48304 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REG1BP48304 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REG1BP48304 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
REG1BP48304 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
REG1BP48304 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REG1BP48304 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REG1BP48304 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REG1BP48304 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REG1BP48304 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REG1BP48304 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REG1BP48304 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REG1BP48304 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.27■■□□□ 1
REG1BP48304 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REG1BP48304 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REG1BP48304 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REG1BP48304 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REG1BP48304 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REG1BP48304 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REG1BP48304 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REG1BP48304 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REG1BP48304 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REG1BP48304 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REG1BP48304 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REG1BP48304 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REG1BP48304 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REG1BP48304 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REG1BP48304 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REG1BP48304 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REG1BP48304 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REG1BP48304 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
REG1BP48304 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
REG1BP48304 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REG1BP48304 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REG1BP48304 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REG1BP48304 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
REG1BP48304 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
REG1BP48304 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REG1BP48304 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REG1BP48304 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REG1BP48304 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
REG1BP48304 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
REG1BP48304 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REG1BP48304 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
REG1BP48304 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
REG1BP48304 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REG1BP48304 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REG1BP48304 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
REG1BP48304 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
REG1BP48304 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
REG1BP48304 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
REG1BP48304 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms