Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRATP43155 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRATP43155 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRATP43155 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRATP43155 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRATP43155 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CRATP43155 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRATP43155 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRATP43155 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRATP43155 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRATP43155 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRATP43155 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRATP43155 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRATP43155 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRATP43155 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRATP43155 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRATP43155 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRATP43155 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRATP43155 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRATP43155 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRATP43155 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRATP43155 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRATP43155 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRATP43155 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRATP43155 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRATP43155 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRATP43155 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRATP43155 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRATP43155 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRATP43155 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRATP43155 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRATP43155 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRATP43155 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRATP43155 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRATP43155 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRATP43155 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRATP43155 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRATP43155 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRATP43155 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRATP43155 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRATP43155 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRATP43155 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRATP43155 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRATP43155 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRATP43155 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRATP43155 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRATP43155 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRATP43155 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRATP43155 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRATP43155 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRATP43155 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRATP43155 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRATP43155 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRATP43155 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRATP43155 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRATP43155 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRATP43155 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRATP43155 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRATP43155 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRATP43155 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRATP43155 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRATP43155 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRATP43155 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRATP43155 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRATP43155 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRATP43155 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRATP43155 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRATP43155 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRATP43155 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRATP43155 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRATP43155 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRATP43155 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRATP43155 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRATP43155 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRATP43155 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRATP43155 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRATP43155 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRATP43155 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRATP43155 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRATP43155 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRATP43155 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRATP43155 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRATP43155 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CRATP43155 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRATP43155 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRATP43155 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRATP43155 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CRATP43155 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRATP43155 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CRATP43155 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CRATP43155 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRATP43155 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRATP43155 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CRATP43155 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRATP43155 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRATP43155 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRATP43155 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRATP43155 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CRATP43155 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CRATP43155 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms