Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A3P43003 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC1A3P43003 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC1A3P43003 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A3P43003 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC1A3P43003 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms