Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECI1P42126 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECI1P42126 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECI1P42126 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECI1P42126 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECI1P42126 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECI1P42126 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECI1P42126 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECI1P42126 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECI1P42126 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECI1P42126 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECI1P42126 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECI1P42126 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECI1P42126 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECI1P42126 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECI1P42126 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECI1P42126 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECI1P42126 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECI1P42126 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECI1P42126 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECI1P42126 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ECI1P42126 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECI1P42126 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECI1P42126 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECI1P42126 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECI1P42126 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECI1P42126 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECI1P42126 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECI1P42126 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECI1P42126 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECI1P42126 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECI1P42126 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECI1P42126 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECI1P42126 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECI1P42126 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECI1P42126 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECI1P42126 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECI1P42126 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECI1P42126 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECI1P42126 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECI1P42126 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECI1P42126 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECI1P42126 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECI1P42126 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ECI1P42126 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECI1P42126 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECI1P42126 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECI1P42126 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECI1P42126 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECI1P42126 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECI1P42126 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECI1P42126 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECI1P42126 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECI1P42126 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECI1P42126 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECI1P42126 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ECI1P42126 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECI1P42126 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECI1P42126 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ECI1P42126 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECI1P42126 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECI1P42126 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECI1P42126 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECI1P42126 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECI1P42126 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ECI1P42126 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECI1P42126 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECI1P42126 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECI1P42126 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECI1P42126 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECI1P42126 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECI1P42126 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECI1P42126 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECI1P42126 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECI1P42126 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECI1P42126 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECI1P42126 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECI1P42126 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECI1P42126 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECI1P42126 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECI1P42126 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECI1P42126 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECI1P42126 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECI1P42126 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECI1P42126 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECI1P42126 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECI1P42126 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECI1P42126 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECI1P42126 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECI1P42126 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECI1P42126 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECI1P42126 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECI1P42126 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECI1P42126 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECI1P42126 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECI1P42126 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECI1P42126 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECI1P42126 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECI1P42126 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECI1P42126 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms