Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K8P41279 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAP3K8P41279 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAP3K8P41279 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MAP3K8P41279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K8P41279 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K8P41279 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K8P41279 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K8P41279 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAP3K8P41279 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms