Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGDSP41222 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGDSP41222 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGDSP41222 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGDSP41222 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDSP41222 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDSP41222 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGDSP41222 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGDSP41222 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGDSP41222 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGDSP41222 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGDSP41222 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGDSP41222 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms