Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTRLP40313 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CTRLP40313 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTRLP40313 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTRLP40313 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTRLP40313 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTRLP40313 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTRLP40313 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTRLP40313 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTRLP40313 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTRLP40313 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTRLP40313 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTRLP40313 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTRLP40313 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTRLP40313 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTRLP40313 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTRLP40313 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTRLP40313 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTRLP40313 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTRLP40313 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTRLP40313 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTRLP40313 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTRLP40313 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTRLP40313 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTRLP40313 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTRLP40313 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTRLP40313 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTRLP40313 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTRLP40313 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CTRLP40313 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTRLP40313 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CTRLP40313 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTRLP40313 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTRLP40313 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTRLP40313 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CTRLP40313 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTRLP40313 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTRLP40313 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTRLP40313 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CTRLP40313 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTRLP40313 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTRLP40313 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTRLP40313 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTRLP40313 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTRLP40313 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTRLP40313 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTRLP40313 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTRLP40313 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTRLP40313 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTRLP40313 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTRLP40313 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTRLP40313 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTRLP40313 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTRLP40313 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTRLP40313 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTRLP40313 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTRLP40313 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTRLP40313 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTRLP40313 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTRLP40313 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTRLP40313 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTRLP40313 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTRLP40313 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CTRLP40313 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CTRLP40313 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTRLP40313 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTRLP40313 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTRLP40313 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CTRLP40313 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTRLP40313 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTRLP40313 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CTRLP40313 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CTRLP40313 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTRLP40313 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTRLP40313 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CTRLP40313 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTRLP40313 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTRLP40313 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTRLP40313 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTRLP40313 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTRLP40313 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTRLP40313 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTRLP40313 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTRLP40313 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTRLP40313 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTRLP40313 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTRLP40313 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTRLP40313 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTRLP40313 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTRLP40313 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTRLP40313 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTRLP40313 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTRLP40313 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTRLP40313 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTRLP40313 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTRLP40313 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTRLP40313 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTRLP40313 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTRLP40313 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTRLP40313 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms