Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF4A3P38919 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF4A3P38919 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF4A3P38919 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF4A3P38919 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4A3P38919 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4A3P38919 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4A3P38919 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4A3P38919 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF4A3P38919 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF4A3P38919 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EIF4A3P38919 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EIF4A3P38919 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EIF4A3P38919 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EIF4A3P38919 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms