Protein–RNA interactions for Protein: P38772

BCD1, Box C/D snoRNA protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BCD1P38772 THI72YOR192C 1800 nt9.65□□□□□ -0.86
BCD1P38772 YJR114WYJR114W 393 nt9.64□□□□□ -0.87
BCD1P38772 CTI6YPL181W 1521 nt9.62□□□□□ -0.87
BCD1P38772 ELO1YJL196C 933 nt9.62□□□□□ -0.87
BCD1P38772 STE4YOR212W 1272 nt9.62□□□□□ -0.87
BCD1P38772 ODC1YPL134C 933 nt9.62□□□□□ -0.87
BCD1P38772 IML3YBR107C 738 nt9.61□□□□□ -0.87
BCD1P38772 RPD3YNL330C 1302 nt9.6□□□□□ -0.87
BCD1P38772 OPI3YJR073C 621 nt9.59□□□□□ -0.87
BCD1P38772 SSL2YIL143C 2532 nt9.58□□□□□ -0.88
BCD1P38772 SPS100YHR139C 981 nt9.58□□□□□ -0.88
BCD1P38772 TIM44YIL022W 1296 nt9.58□□□□□ -0.88
BCD1P38772 YNR064CYNR064C 873 nt9.58□□□□□ -0.88
BCD1P38772 VMA11YPL234C 495 nt9.58□□□□□ -0.88
BCD1P38772 TVP23YDR084C 600 nt9.55□□□□□ -0.88
BCD1P38772 TAF13YML098W 504 nt9.55□□□□□ -0.88
BCD1P38772 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.54□□□□□ -0.88
BCD1P38772 YLR349WYLR349W 507 nt9.54□□□□□ -0.88
BCD1P38772 SNX3YOR357C 489 nt9.54□□□□□ -0.88
BCD1P38772 DMA2YNL116W 1569 nt9.54□□□□□ -0.88
BCD1P38772 MHF1YOL086W-A 273 nt9.52□□□□□ -0.89
BCD1P38772 CPD1YGR247W 720 nt9.51□□□□□ -0.89
BCD1P38772 ABZ2YMR289W 1125 nt9.51□□□□□ -0.89
BCD1P38772 RAD51YER095W 1203 nt9.5□□□□□ -0.89
BCD1P38772 CWP2YKL096W-A 279 nt9.5□□□□□ -0.89
BCD1P38772 PSD1YNL169C 1503 nt9.5□□□□□ -0.89
BCD1P38772 ENO2YHR174W 1314 nt9.5□□□□□ -0.89
BCD1P38772 KEL3YPL263C 1956 nt9.5□□□□□ -0.89
BCD1P38772 ADH7YCR105W 1086 nt9.49□□□□□ -0.89
BCD1P38772 POT1YIL160C 1254 nt9.49□□□□□ -0.89
BCD1P38772 YMR265CYMR265C 1386 nt9.49□□□□□ -0.89
BCD1P38772 MDM35YKL053C-A 261 nt9.48□□□□□ -0.89
BCD1P38772 YMR262WYMR262W 942 nt9.48□□□□□ -0.89
BCD1P38772 CYT1YOR065W 930 nt9.47□□□□□ -0.89
BCD1P38772 SUV3YPL029W 2214 nt9.47□□□□□ -0.89
BCD1P38772 PAU15YIR041W 375 nt9.46□□□□□ -0.9
BCD1P38772 HAP5YOR358W 729 nt9.46□□□□□ -0.9
BCD1P38772 RPC31YNL151C 756 nt9.45□□□□□ -0.9
BCD1P38772 YGR139WYGR139W 339 nt9.44□□□□□ -0.9
BCD1P38772 AMF1YOR378W 1548 nt9.44□□□□□ -0.9
BCD1P38772 SFL1YOR140W 2301 nt9.44□□□□□ -0.9
BCD1P38772 RPN14YGL004C 1254 nt9.43□□□□□ -0.9
BCD1P38772 MET1YKR069W 1782 nt9.42□□□□□ -0.9
BCD1P38772 MCM5YLR274W 2328 nt9.42□□□□□ -0.9
BCD1P38772 TPC1YGR096W 945 nt9.42□□□□□ -0.9
BCD1P38772 CRC1YOR100C 984 nt9.42□□□□□ -0.9
BCD1P38772 PCP1YGR101W 1041 nt9.41□□□□□ -0.9
BCD1P38772 SWT21YNL187W 1074 nt9.41□□□□□ -0.9
BCD1P38772 GID7YCL039W 2238 nt9.41□□□□□ -0.9
BCD1P38772 MAE1YKL029C 2010 nt9.41□□□□□ -0.9
BCD1P38772 MAS1YLR163C 1389 nt9.4□□□□□ -0.9
BCD1P38772 YKL053WYKL053W 375 nt9.4□□□□□ -0.9
BCD1P38772 RIM2YBR192W 1134 nt9.4□□□□□ -0.9
BCD1P38772 HXT10YFL011W 1641 nt9.4□□□□□ -0.9
BCD1P38772 DPL1YDR294C 1770 nt9.4□□□□□ -0.91
BCD1P38772 APS2YJR058C 444 nt9.39□□□□□ -0.91
BCD1P38772 snR31snR31 225 nt9.39□□□□□ -0.91
BCD1P38772 NIF3YGL221C 867 nt9.38□□□□□ -0.91
BCD1P38772 PAU5YFL020C 369 nt9.37□□□□□ -0.91
BCD1P38772 KRE1YNL322C 942 nt9.37□□□□□ -0.91
BCD1P38772 SPE2YOL052C 1191 nt9.37□□□□□ -0.91
BCD1P38772 YHR218WYHR218W 1812 nt9.36□□□□□ -0.91
BCD1P38772 KRR1YCL059C 951 nt9.36□□□□□ -0.91
BCD1P38772 TUB4YLR212C 1422 nt9.35□□□□□ -0.91
BCD1P38772 GSF2YML048W 1212 nt9.35□□□□□ -0.91
BCD1P38772 MET2YNL277W 1461 nt9.34□□□□□ -0.91
BCD1P38772 LEU4YNL104C 1860 nt9.34□□□□□ -0.91
BCD1P38772 ESBP6YNL125C 2022 nt9.33□□□□□ -0.92
BCD1P38772 KGD2YDR148C 1392 nt9.33□□□□□ -0.92
BCD1P38772 LEU2YCL018W 1095 nt9.32□□□□□ -0.92
BCD1P38772 ACO2YJL200C 2370 nt9.32□□□□□ -0.92
BCD1P38772 NAM8YHR086W 1572 nt9.32□□□□□ -0.92
BCD1P38772 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.31□□□□□ -0.92
BCD1P38772 YDR467CYDR467C 327 nt9.3□□□□□ -0.92
BCD1P38772 AGP3YFL055W 1677 nt9.29□□□□□ -0.92
BCD1P38772 NAS2YIL007C 663 nt9.28□□□□□ -0.92
BCD1P38772 INH1YDL181W 258 nt9.27□□□□□ -0.93
BCD1P38772 PGC1YPL206C 966 nt9.26□□□□□ -0.93
BCD1P38772 SRP54YPR088C 1626 nt9.26□□□□□ -0.93
BCD1P38772 SAN1YDR143C 1833 nt9.25□□□□□ -0.93
BCD1P38772 SFP1YLR403W 2052 nt9.25□□□□□ -0.93
BCD1P38772 HEM14YER014W 1620 nt9.24□□□□□ -0.93
BCD1P38772 GPM1YKL152C 744 nt9.23□□□□□ -0.93
BCD1P38772 YKR012CYKR012C 378 nt9.23□□□□□ -0.93
BCD1P38772 STP3YLR375W 1032 nt9.23□□□□□ -0.93
BCD1P38772 NPP2YEL016C 1482 nt9.22□□□□□ -0.93
BCD1P38772 ESS1YJR017C 513 nt9.22□□□□□ -0.93
BCD1P38772 THP3YPR045C 1413 nt9.22□□□□□ -0.93
BCD1P38772 SBP1YHL034C 885 nt9.21□□□□□ -0.94
BCD1P38772 REX2YLR059C 810 nt9.21□□□□□ -0.94
BCD1P38772 NPP1YCR026C 2229 nt9.21□□□□□ -0.94
BCD1P38772 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.2□□□□□ -0.94
BCD1P38772 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.2□□□□□ -0.94
BCD1P38772 IGD1YFR017C 588 nt9.19□□□□□ -0.94
BCD1P38772 CDD1YLR245C 429 nt9.19□□□□□ -0.94
BCD1P38772 Q0010Q0010 387 nt9.19□□□□□ -0.94
BCD1P38772 THI3YDL080C 1830 nt9.19□□□□□ -0.94
BCD1P38772 GGA2YHR108W 1758 nt9.18□□□□□ -0.94
BCD1P38772 YHL008CYHL008C 1884 nt9.17□□□□□ -0.94
BCD1P38772 PTC6YCR079W 1329 nt9.17□□□□□ -0.94
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