Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 DLD3YEL071W 1491 nt7.91□□□□□ -1.14
VBA2P38358 MRS6YOR370C 1812 nt7.91□□□□□ -1.14
VBA2P38358 YHR219WYHR219W 1875 nt7.89□□□□□ -1.15
VBA2P38358 YJL195CYJL195C 702 nt7.89□□□□□ -1.15
VBA2P38358 RPD3YNL330C 1302 nt7.88□□□□□ -1.15
VBA2P38358 MCM5YLR274W 2328 nt7.87□□□□□ -1.15
VBA2P38358 CWP2YKL096W-A 279 nt7.87□□□□□ -1.15
VBA2P38358 ODC1YPL134C 933 nt7.87□□□□□ -1.15
VBA2P38358 DAK2YFL053W 1776 nt7.87□□□□□ -1.15
VBA2P38358 TIP1YBR067C 633 nt7.86□□□□□ -1.15
VBA2P38358 DMA2YNL116W 1569 nt7.85□□□□□ -1.15
VBA2P38358 SSL2YIL143C 2532 nt7.85□□□□□ -1.15
VBA2P38358 ADE8YDR408C 645 nt7.85□□□□□ -1.15
VBA2P38358 LSR1LSR1 1175 nt7.85□□□□□ -1.15
VBA2P38358 CYT1YOR065W 930 nt7.85□□□□□ -1.15
VBA2P38358 VMA11YPL234C 495 nt7.85□□□□□ -1.15
VBA2P38358 ITR2YOL103W 1830 nt7.85□□□□□ -1.15
VBA2P38358 CCT5YJR064W 1689 nt7.84□□□□□ -1.15
VBA2P38358 TIM44YIL022W 1296 nt7.84□□□□□ -1.15
VBA2P38358 YJR114WYJR114W 393 nt7.84□□□□□ -1.15
VBA2P38358 FUN14YAL008W 597 nt7.83□□□□□ -1.16
VBA2P38358 SAC7YDR389W 1965 nt7.82□□□□□ -1.16
VBA2P38358 ACO2YJL200C 2370 nt7.82□□□□□ -1.16
VBA2P38358 KRR1YCL059C 951 nt7.82□□□□□ -1.16
VBA2P38358 IML3YBR107C 738 nt7.82□□□□□ -1.16
VBA2P38358 PSD1YNL169C 1503 nt7.82□□□□□ -1.16
VBA2P38358 CSM2YIL132C 642 nt7.81□□□□□ -1.16
VBA2P38358 MDM35YKL053C-A 261 nt7.81□□□□□ -1.16
VBA2P38358 YPR126CYPR126C 309 nt7.81□□□□□ -1.16
VBA2P38358 SNZ1YMR096W 894 nt7.8□□□□□ -1.16
VBA2P38358 YEL008WYEL008W 381 nt7.79□□□□□ -1.16
VBA2P38358 YNR064CYNR064C 873 nt7.79□□□□□ -1.16
VBA2P38358 SNX3YOR357C 489 nt7.79□□□□□ -1.16
VBA2P38358 TVP23YDR084C 600 nt7.77□□□□□ -1.17
VBA2P38358 GTB1YDR221W 2109 nt7.77□□□□□ -1.17
VBA2P38358 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.77□□□□□ -1.17
VBA2P38358 SPS100YHR139C 981 nt7.77□□□□□ -1.17
VBA2P38358 YMR262WYMR262W 942 nt7.77□□□□□ -1.17
VBA2P38358 THI72YOR192C 1800 nt7.77□□□□□ -1.17
VBA2P38358 PAB1YER165W 1734 nt7.77□□□□□ -1.17
VBA2P38358 RSC4YKR008W 1878 nt7.77□□□□□ -1.17
VBA2P38358 RPN14YGL004C 1254 nt7.76□□□□□ -1.17
VBA2P38358 ELO1YJL196C 933 nt7.76□□□□□ -1.17
VBA2P38358 OPI3YJR073C 621 nt7.76□□□□□ -1.17
VBA2P38358 CTI6YPL181W 1521 nt7.76□□□□□ -1.17
VBA2P38358 HMG2YLR450W 3138 nt7.76□□□□□ -1.17
VBA2P38358 KEL3YPL263C 1956 nt7.75□□□□□ -1.17
VBA2P38358 YMR265CYMR265C 1386 nt7.75□□□□□ -1.17
VBA2P38358 TAF13YML098W 504 nt7.75□□□□□ -1.17
VBA2P38358 RPC31YNL151C 756 nt7.74□□□□□ -1.17
VBA2P38358 MHF1YOL086W-A 273 nt7.74□□□□□ -1.17
VBA2P38358 HAP5YOR358W 729 nt7.73□□□□□ -1.17
VBA2P38358 snR31snR31 225 nt7.73□□□□□ -1.17
VBA2P38358 MAS1YLR163C 1389 nt7.72□□□□□ -1.17
VBA2P38358 YHR218WYHR218W 1812 nt7.71□□□□□ -1.17
VBA2P38358 ABZ2YMR289W 1125 nt7.71□□□□□ -1.18
VBA2P38358 RIM2YBR192W 1134 nt7.71□□□□□ -1.18
VBA2P38358 GAL2YLR081W 1725 nt7.71□□□□□ -1.18
VBA2P38358 TPO4YOR273C 1980 nt7.7□□□□□ -1.18
VBA2P38358 TOK1YJL093C 2076 nt7.7□□□□□ -1.18
VBA2P38358 POT1YIL160C 1254 nt7.69□□□□□ -1.18
VBA2P38358 HXT10YFL011W 1641 nt7.68□□□□□ -1.18
VBA2P38358 ENO2YHR174W 1314 nt7.68□□□□□ -1.18
VBA2P38358 SUV3YPL029W 2214 nt7.68□□□□□ -1.18
VBA2P38358 INH1YDL181W 258 nt7.67□□□□□ -1.18
VBA2P38358 STE4YOR212W 1272 nt7.67□□□□□ -1.18
VBA2P38358 YHL008CYHL008C 1884 nt7.66□□□□□ -1.18
VBA2P38358 AMF1YOR378W 1548 nt7.66□□□□□ -1.18
VBA2P38358 DPL1YDR294C 1770 nt7.66□□□□□ -1.18
VBA2P38358 PCP1YGR101W 1041 nt7.65□□□□□ -1.18
VBA2P38358 SWT21YNL187W 1074 nt7.65□□□□□ -1.18
VBA2P38358 CRC1YOR100C 984 nt7.64□□□□□ -1.19
VBA2P38358 CPD1YGR247W 720 nt7.63□□□□□ -1.19
VBA2P38358 SFL1YOR140W 2301 nt7.62□□□□□ -1.19
VBA2P38358 MET1YKR069W 1782 nt7.62□□□□□ -1.19
VBA2P38358 AGP3YFL055W 1677 nt7.62□□□□□ -1.19
VBA2P38358 GSF2YML048W 1212 nt7.61□□□□□ -1.19
VBA2P38358 LEU4YNL104C 1860 nt7.61□□□□□ -1.19
VBA2P38358 LEU2YCL018W 1095 nt7.6□□□□□ -1.19
VBA2P38358 YDR467CYDR467C 327 nt7.59□□□□□ -1.19
VBA2P38358 YLR349WYLR349W 507 nt7.59□□□□□ -1.19
VBA2P38358 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.58□□□□□ -1.2
VBA2P38358 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.58□□□□□ -1.2
VBA2P38358 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.58□□□□□ -1.2
VBA2P38358 TPC1YGR096W 945 nt7.58□□□□□ -1.2
VBA2P38358 YIL177CYIL177C 5277 nt7.58□□□□□ -1.2
VBA2P38358 YKL053WYKL053W 375 nt7.57□□□□□ -1.2
VBA2P38358 TUB4YLR212C 1422 nt7.57□□□□□ -1.2
VBA2P38358 URA8YJR103W 1737 nt7.57□□□□□ -1.2
VBA2P38358 KGD2YDR148C 1392 nt7.57□□□□□ -1.2
VBA2P38358 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.54□□□□□ -1.2
VBA2P38358 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.54□□□□□ -1.2
VBA2P38358 NIF3YGL221C 867 nt7.54□□□□□ -1.2
VBA2P38358 GPM1YKL152C 744 nt7.54□□□□□ -1.2
VBA2P38358 KRE1YNL322C 942 nt7.54□□□□□ -1.2
VBA2P38358 FRA1YLL029W 2250 nt7.54□□□□□ -1.2
VBA2P38358 ADH7YCR105W 1086 nt7.53□□□□□ -1.2
VBA2P38358 SBP1YHL034C 885 nt7.53□□□□□ -1.2
VBA2P38358 GGA2YHR108W 1758 nt7.52□□□□□ -1.21
VBA2P38358 NAM8YHR086W 1572 nt7.52□□□□□ -1.21
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