Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP6V1E1P36543 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1E1P36543 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1E1P36543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1E1P36543 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6V1E1P36543 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6V1E1P36543 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms