Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN2P35609 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN2P35609 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ACTN2P35609 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ACTN2P35609 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN2P35609 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN2P35609 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN2P35609 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN2P35609 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN2P35609 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN2P35609 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN2P35609 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN2P35609 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN2P35609 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN2P35609 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN2P35609 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN2P35609 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN2P35609 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN2P35609 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN2P35609 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN2P35609 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN2P35609 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN2P35609 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN2P35609 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN2P35609 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN2P35609 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN2P35609 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACTN2P35609 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN2P35609 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN2P35609 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms