Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THBS2P35442 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS2P35442 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THBS2P35442 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS2P35442 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS2P35442 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS2P35442 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS2P35442 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THBS2P35442 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS2P35442 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS2P35442 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS2P35442 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS2P35442 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS2P35442 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS2P35442 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THBS2P35442 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS2P35442 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS2P35442 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THBS2P35442 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS2P35442 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
THBS2P35442 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THBS2P35442 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS2P35442 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THBS2P35442 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS2P35442 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS2P35442 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS2P35442 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS2P35442 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS2P35442 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
THBS2P35442 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS2P35442 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THBS2P35442 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS2P35442 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS2P35442 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS2P35442 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS2P35442 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS2P35442 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THBS2P35442 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS2P35442 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THBS2P35442 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS2P35442 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS2P35442 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS2P35442 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THBS2P35442 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THBS2P35442 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THBS2P35442 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
THBS2P35442 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THBS2P35442 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THBS2P35442 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THBS2P35442 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
THBS2P35442 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
THBS2P35442 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THBS2P35442 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THBS2P35442 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THBS2P35442 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
THBS2P35442 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THBS2P35442 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THBS2P35442 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THBS2P35442 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THBS2P35442 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS2P35442 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS2P35442 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THBS2P35442 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THBS2P35442 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS2P35442 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS2P35442 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THBS2P35442 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THBS2P35442 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THBS2P35442 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS2P35442 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS2P35442 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS2P35442 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS2P35442 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THBS2P35442 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THBS2P35442 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THBS2P35442 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THBS2P35442 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THBS2P35442 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THBS2P35442 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THBS2P35442 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THBS2P35442 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THBS2P35442 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THBS2P35442 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS2P35442 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS2P35442 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS2P35442 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS2P35442 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS2P35442 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS2P35442 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THBS2P35442 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
THBS2P35442 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THBS2P35442 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
THBS2P35442 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS2P35442 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS2P35442 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS2P35442 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THBS2P35442 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23■■□□□ 1.27
THBS2P35442 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
THBS2P35442 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
THBS2P35442 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms