Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORAP35398 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORAP35398 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORAP35398 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORAP35398 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORAP35398 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RORAP35398 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RORAP35398 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RORAP35398 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RORAP35398 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORAP35398 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RORAP35398 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORAP35398 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORAP35398 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORAP35398 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RORAP35398 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RORAP35398 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RORAP35398 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RORAP35398 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RORAP35398 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RORAP35398 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RORAP35398 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RORAP35398 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RORAP35398 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RORAP35398 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RORAP35398 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RORAP35398 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORAP35398 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORAP35398 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORAP35398 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORAP35398 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RORAP35398 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RORAP35398 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RORAP35398 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RORAP35398 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RORAP35398 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RORAP35398 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RORAP35398 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RORAP35398 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RORAP35398 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RORAP35398 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RORAP35398 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RORAP35398 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RORAP35398 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RORAP35398 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RORAP35398 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RORAP35398 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RORAP35398 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RORAP35398 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RORAP35398 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RORAP35398 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RORAP35398 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RORAP35398 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RORAP35398 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RORAP35398 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RORAP35398 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RORAP35398 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RORAP35398 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RORAP35398 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RORAP35398 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RORAP35398 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RORAP35398 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RORAP35398 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RORAP35398 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RORAP35398 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RORAP35398 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RORAP35398 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RORAP35398 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RORAP35398 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RORAP35398 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RORAP35398 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RORAP35398 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RORAP35398 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RORAP35398 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RORAP35398 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RORAP35398 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RORAP35398 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RORAP35398 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RORAP35398 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RORAP35398 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORAP35398 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORAP35398 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORAP35398 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORAP35398 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORAP35398 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORAP35398 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORAP35398 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RORAP35398 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RORAP35398 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RORAP35398 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RORAP35398 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RORAP35398 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms