Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DSG3P32926 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DSG3P32926 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DSG3P32926 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DSG3P32926 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DSG3P32926 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DSG3P32926 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DSG3P32926 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DSG3P32926 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DSG3P32926 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DSG3P32926 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DSG3P32926 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DSG3P32926 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DSG3P32926 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DSG3P32926 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
DSG3P32926 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DSG3P32926 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DSG3P32926 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DSG3P32926 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DSG3P32926 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
DSG3P32926 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DSG3P32926 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DSG3P32926 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DSG3P32926 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DSG3P32926 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DSG3P32926 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DSG3P32926 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DSG3P32926 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DSG3P32926 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DSG3P32926 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DSG3P32926 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DSG3P32926 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DSG3P32926 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DSG3P32926 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DSG3P32926 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DSG3P32926 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DSG3P32926 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DSG3P32926 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DSG3P32926 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DSG3P32926 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DSG3P32926 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DSG3P32926 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DSG3P32926 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DSG3P32926 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DSG3P32926 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DSG3P32926 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DSG3P32926 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DSG3P32926 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
DSG3P32926 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DSG3P32926 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
DSG3P32926 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DSG3P32926 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
DSG3P32926 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
DSG3P32926 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
DSG3P32926 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DSG3P32926 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DSG3P32926 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
DSG3P32926 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
DSG3P32926 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DSG3P32926 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DSG3P32926 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
DSG3P32926 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
DSG3P32926 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
DSG3P32926 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
DSG3P32926 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
DSG3P32926 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DSG3P32926 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
DSG3P32926 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
DSG3P32926 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DSG3P32926 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DSG3P32926 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
DSG3P32926 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DSG3P32926 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DSG3P32926 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DSG3P32926 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DSG3P32926 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DSG3P32926 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DSG3P32926 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DSG3P32926 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DSG3P32926 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DSG3P32926 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DSG3P32926 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DSG3P32926 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DSG3P32926 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DSG3P32926 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
DSG3P32926 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DSG3P32926 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DSG3P32926 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DSG3P32926 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DSG3P32926 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms