Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR2BP30876 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2BP30876 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2BP30876 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2BP30876 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2BP30876 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR2BP30876 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms