Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSPOP30536 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSPOP30536 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSPOP30536 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSPOP30536 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSPOP30536 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSPOP30536 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSPOP30536 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSPOP30536 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSPOP30536 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSPOP30536 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSPOP30536 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSPOP30536 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSPOP30536 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSPOP30536 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSPOP30536 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSPOP30536 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSPOP30536 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TSPOP30536 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSPOP30536 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TSPOP30536 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSPOP30536 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TSPOP30536 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSPOP30536 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TSPOP30536 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSPOP30536 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSPOP30536 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TSPOP30536 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSPOP30536 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSPOP30536 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSPOP30536 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TSPOP30536 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPOP30536 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPOP30536 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPOP30536 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPOP30536 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPOP30536 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPOP30536 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPOP30536 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TSPOP30536 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSPOP30536 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSPOP30536 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSPOP30536 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSPOP30536 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSPOP30536 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TSPOP30536 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSPOP30536 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TSPOP30536 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSPOP30536 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSPOP30536 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TSPOP30536 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TSPOP30536 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPOP30536 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPOP30536 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPOP30536 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TSPOP30536 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPOP30536 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPOP30536 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPOP30536 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPOP30536 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPOP30536 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPOP30536 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPOP30536 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TSPOP30536 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPOP30536 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPOP30536 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPOP30536 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TSPOP30536 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPOP30536 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPOP30536 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPOP30536 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TSPOP30536 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPOP30536 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPOP30536 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TSPOP30536 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPOP30536 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPOP30536 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TSPOP30536 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPOP30536 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TSPOP30536 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPOP30536 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TSPOP30536 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPOP30536 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPOP30536 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPOP30536 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TSPOP30536 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPOP30536 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPOP30536 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPOP30536 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPOP30536 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPOP30536 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TSPOP30536 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPOP30536 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPOP30536 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPOP30536 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TSPOP30536 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPOP30536 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPOP30536 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPOP30536 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TSPOP30536 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms