Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMLP29590 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMLP29590 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMLP29590 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMLP29590 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMLP29590 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMLP29590 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMLP29590 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMLP29590 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMLP29590 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMLP29590 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMLP29590 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMLP29590 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PMLP29590 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMLP29590 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMLP29590 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMLP29590 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMLP29590 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMLP29590 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMLP29590 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMLP29590 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMLP29590 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMLP29590 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMLP29590 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMLP29590 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMLP29590 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMLP29590 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMLP29590 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMLP29590 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PMLP29590 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PMLP29590 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PMLP29590 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PMLP29590 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PMLP29590 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PMLP29590 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PMLP29590 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PMLP29590 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PMLP29590 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PMLP29590 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMLP29590 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PMLP29590 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PMLP29590 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PMLP29590 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMLP29590 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PMLP29590 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PMLP29590 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PMLP29590 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMLP29590 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMLP29590 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMLP29590 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMLP29590 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PMLP29590 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMLP29590 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PMLP29590 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMLP29590 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMLP29590 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PMLP29590 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMLP29590 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMLP29590 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMLP29590 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PMLP29590 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMLP29590 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMLP29590 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMLP29590 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PMLP29590 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMLP29590 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMLP29590 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PMLP29590 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PMLP29590 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMLP29590 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PMLP29590 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PMLP29590 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PMLP29590 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PMLP29590 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMLP29590 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMLP29590 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMLP29590 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMLP29590 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMLP29590 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PMLP29590 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PMLP29590 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMLP29590 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMLP29590 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMLP29590 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PMLP29590 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMLP29590 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PMLP29590 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMLP29590 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMLP29590 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMLP29590 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMLP29590 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMLP29590 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMLP29590 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PMLP29590 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMLP29590 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMLP29590 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PMLP29590 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMLP29590 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMLP29590 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PMLP29590 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms