Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHC1P29353 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHC1P29353 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHC1P29353 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHC1P29353 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHC1P29353 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHC1P29353 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHC1P29353 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHC1P29353 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHC1P29353 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHC1P29353 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHC1P29353 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHC1P29353 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHC1P29353 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHC1P29353 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHC1P29353 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHC1P29353 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHC1P29353 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHC1P29353 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHC1P29353 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHC1P29353 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHC1P29353 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHC1P29353 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHC1P29353 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHC1P29353 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHC1P29353 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHC1P29353 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHC1P29353 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHC1P29353 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHC1P29353 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHC1P29353 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHC1P29353 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHC1P29353 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHC1P29353 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHC1P29353 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHC1P29353 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHC1P29353 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHC1P29353 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHC1P29353 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHC1P29353 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHC1P29353 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHC1P29353 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SHC1P29353 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHC1P29353 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHC1P29353 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHC1P29353 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHC1P29353 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHC1P29353 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHC1P29353 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHC1P29353 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHC1P29353 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHC1P29353 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHC1P29353 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHC1P29353 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHC1P29353 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHC1P29353 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHC1P29353 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHC1P29353 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHC1P29353 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHC1P29353 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHC1P29353 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHC1P29353 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHC1P29353 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHC1P29353 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHC1P29353 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHC1P29353 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHC1P29353 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHC1P29353 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHC1P29353 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SHC1P29353 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHC1P29353 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHC1P29353 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHC1P29353 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHC1P29353 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHC1P29353 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHC1P29353 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHC1P29353 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHC1P29353 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SHC1P29353 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHC1P29353 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHC1P29353 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHC1P29353 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHC1P29353 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHC1P29353 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHC1P29353 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHC1P29353 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHC1P29353 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHC1P29353 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHC1P29353 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHC1P29353 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHC1P29353 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHC1P29353 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHC1P29353 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHC1P29353 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SHC1P29353 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHC1P29353 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHC1P29353 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHC1P29353 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHC1P29353 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHC1P29353 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms