Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD1CP29017 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD1CP29017 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD1CP29017 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CD1CP29017 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD1CP29017 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD1CP29017 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD1CP29017 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD1CP29017 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD1CP29017 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD1CP29017 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD1CP29017 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD1CP29017 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD1CP29017 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD1CP29017 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD1CP29017 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CD1CP29017 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CD1CP29017 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD1CP29017 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD1CP29017 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD1CP29017 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD1CP29017 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CD1CP29017 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD1CP29017 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD1CP29017 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD1CP29017 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD1CP29017 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD1CP29017 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD1CP29017 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD1CP29017 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD1CP29017 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD1CP29017 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD1CP29017 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD1CP29017 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD1CP29017 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD1CP29017 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CD1CP29017 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD1CP29017 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD1CP29017 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD1CP29017 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD1CP29017 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD1CP29017 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD1CP29017 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD1CP29017 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD1CP29017 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD1CP29017 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD1CP29017 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD1CP29017 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD1CP29017 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD1CP29017 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD1CP29017 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD1CP29017 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD1CP29017 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD1CP29017 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CD1CP29017 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD1CP29017 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD1CP29017 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD1CP29017 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD1CP29017 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CD1CP29017 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD1CP29017 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD1CP29017 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD1CP29017 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD1CP29017 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD1CP29017 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD1CP29017 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD1CP29017 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD1CP29017 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD1CP29017 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD1CP29017 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD1CP29017 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD1CP29017 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD1CP29017 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD1CP29017 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD1CP29017 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD1CP29017 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD1CP29017 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD1CP29017 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD1CP29017 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD1CP29017 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD1CP29017 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD1CP29017 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD1CP29017 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD1CP29017 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD1CP29017 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD1CP29017 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD1CP29017 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD1CP29017 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD1CP29017 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD1CP29017 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms