Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POU1F1P28069 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POU1F1P28069 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POU1F1P28069 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POU1F1P28069 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POU1F1P28069 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POU1F1P28069 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms