Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms