Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
YY1P25490 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YY1P25490 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
YY1P25490 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
YY1P25490 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
YY1P25490 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
YY1P25490 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
YY1P25490 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
YY1P25490 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
YY1P25490 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
YY1P25490 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
YY1P25490 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
YY1P25490 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
YY1P25490 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
YY1P25490 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
YY1P25490 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YY1P25490 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
YY1P25490 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
YY1P25490 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
YY1P25490 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
YY1P25490 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
YY1P25490 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
YY1P25490 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
YY1P25490 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
YY1P25490 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
YY1P25490 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
YY1P25490 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
YY1P25490 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
YY1P25490 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
YY1P25490 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
YY1P25490 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
YY1P25490 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
YY1P25490 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
YY1P25490 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
YY1P25490 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
YY1P25490 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
YY1P25490 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
YY1P25490 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
YY1P25490 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
YY1P25490 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
YY1P25490 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
YY1P25490 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
YY1P25490 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
YY1P25490 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
YY1P25490 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
YY1P25490 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
YY1P25490 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
YY1P25490 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
YY1P25490 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
YY1P25490 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
YY1P25490 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
YY1P25490 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
YY1P25490 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
YY1P25490 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
YY1P25490 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
YY1P25490 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
YY1P25490 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
YY1P25490 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
YY1P25490 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
YY1P25490 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
YY1P25490 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
YY1P25490 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
YY1P25490 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
YY1P25490 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
YY1P25490 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
YY1P25490 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
YY1P25490 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
YY1P25490 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
YY1P25490 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
YY1P25490 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
YY1P25490 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
YY1P25490 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
YY1P25490 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
YY1P25490 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
YY1P25490 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
YY1P25490 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
YY1P25490 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
YY1P25490 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
YY1P25490 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
YY1P25490 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
YY1P25490 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
YY1P25490 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
YY1P25490 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
YY1P25490 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
YY1P25490 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
YY1P25490 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
YY1P25490 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
YY1P25490 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
YY1P25490 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
YY1P25490 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
YY1P25490 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
YY1P25490 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
YY1P25490 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
YY1P25490 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
YY1P25490 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
YY1P25490 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
YY1P25490 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
YY1P25490 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
YY1P25490 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
YY1P25490 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms