Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3P25205 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3P25205 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MCM3P25205 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3P25205 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3P25205 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MCM3P25205 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM3P25205 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM3P25205 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM3P25205 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM3P25205 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCM3P25205 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3P25205 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3P25205 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3P25205 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MCM3P25205 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCM3P25205 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MCM3P25205 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MCM3P25205 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCM3P25205 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCM3P25205 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MCM3P25205 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCM3P25205 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MCM3P25205 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCM3P25205 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3P25205 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3P25205 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3P25205 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3P25205 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MCM3P25205 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MCM3P25205 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM3P25205 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCM3P25205 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM3P25205 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM3P25205 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MCM3P25205 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3P25205 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3P25205 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3P25205 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCM3P25205 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM3P25205 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCM3P25205 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3P25205 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3P25205 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3P25205 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3P25205 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3P25205 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MCM3P25205 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM3P25205 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCM3P25205 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MCM3P25205 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCM3P25205 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCM3P25205 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3P25205 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCM3P25205 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCM3P25205 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM3P25205 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM3P25205 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM3P25205 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCM3P25205 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM3P25205 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCM3P25205 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCM3P25205 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM3P25205 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM3P25205 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCM3P25205 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MCM3P25205 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3P25205 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3P25205 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3P25205 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3P25205 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MCM3P25205 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3P25205 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3P25205 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MCM3P25205 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCM3P25205 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3P25205 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCM3P25205 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3P25205 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCM3P25205 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM3P25205 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCM3P25205 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3P25205 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3P25205 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3P25205 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3P25205 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCM3P25205 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCM3P25205 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MCM3P25205 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3P25205 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MCM3P25205 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM3P25205 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM3P25205 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MCM3P25205 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3P25205 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3P25205 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3P25205 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3P25205 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3P25205 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCM3P25205 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms