Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EIF4BP23588 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
EIF4BP23588 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EIF4BP23588 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4BP23588 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4BP23588 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4BP23588 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4BP23588 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms