Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CA6P23280 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA6P23280 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA6P23280 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CA6P23280 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CA6P23280 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CA6P23280 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA6P23280 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA6P23280 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA6P23280 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA6P23280 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA6P23280 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA6P23280 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CA6P23280 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA6P23280 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA6P23280 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA6P23280 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA6P23280 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA6P23280 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA6P23280 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA6P23280 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CA6P23280 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA6P23280 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CA6P23280 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA6P23280 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA6P23280 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CA6P23280 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CA6P23280 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA6P23280 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA6P23280 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA6P23280 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA6P23280 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CA6P23280 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CA6P23280 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA6P23280 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CA6P23280 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CA6P23280 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA6P23280 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA6P23280 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA6P23280 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA6P23280 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CA6P23280 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA6P23280 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA6P23280 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA6P23280 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CA6P23280 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA6P23280 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA6P23280 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA6P23280 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA6P23280 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CA6P23280 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA6P23280 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CA6P23280 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CA6P23280 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA6P23280 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CA6P23280 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA6P23280 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CA6P23280 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CA6P23280 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA6P23280 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CA6P23280 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA6P23280 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA6P23280 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA6P23280 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CA6P23280 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA6P23280 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA6P23280 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA6P23280 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA6P23280 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA6P23280 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA6P23280 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA6P23280 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA6P23280 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA6P23280 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA6P23280 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA6P23280 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA6P23280 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA6P23280 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA6P23280 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA6P23280 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA6P23280 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA6P23280 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA6P23280 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA6P23280 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA6P23280 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA6P23280 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA6P23280 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA6P23280 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CA6P23280 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA6P23280 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA6P23280 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA6P23280 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA6P23280 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA6P23280 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA6P23280 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA6P23280 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA6P23280 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA6P23280 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CA6P23280 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA6P23280 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms