Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKACGP22612 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKACGP22612 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKACGP22612 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKACGP22612 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKACGP22612 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKACGP22612 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKACGP22612 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKACGP22612 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKACGP22612 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKACGP22612 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKACGP22612 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms