Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPS1L1P21108 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPS1L1P21108 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPS1L1P21108 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPS1L1P21108 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRPS1L1P21108 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms