Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN3P20807 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN3P20807 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN3P20807 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN3P20807 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPN3P20807 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN3P20807 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms