Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA5P20719 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA5P20719 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA5P20719 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA5P20719 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXA5P20719 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms