Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCN1P20061 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TCN1P20061 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCN1P20061 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCN1P20061 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCN1P20061 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCN1P20061 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCN1P20061 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCN1P20061 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCN1P20061 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCN1P20061 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCN1P20061 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCN1P20061 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN1P20061 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN1P20061 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN1P20061 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN1P20061 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN1P20061 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN1P20061 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN1P20061 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCN1P20061 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCN1P20061 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCN1P20061 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCN1P20061 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCN1P20061 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCN1P20061 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCN1P20061 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCN1P20061 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCN1P20061 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCN1P20061 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCN1P20061 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN1P20061 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN1P20061 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN1P20061 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN1P20061 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCN1P20061 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCN1P20061 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCN1P20061 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCN1P20061 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCN1P20061 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCN1P20061 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCN1P20061 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCN1P20061 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCN1P20061 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCN1P20061 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCN1P20061 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCN1P20061 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCN1P20061 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCN1P20061 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCN1P20061 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TCN1P20061 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCN1P20061 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCN1P20061 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TCN1P20061 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCN1P20061 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TCN1P20061 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCN1P20061 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TCN1P20061 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TCN1P20061 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCN1P20061 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCN1P20061 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TCN1P20061 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCN1P20061 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCN1P20061 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCN1P20061 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCN1P20061 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TCN1P20061 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCN1P20061 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCN1P20061 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TCN1P20061 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TCN1P20061 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TCN1P20061 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TCN1P20061 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN1P20061 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN1P20061 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN1P20061 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN1P20061 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TCN1P20061 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCN1P20061 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCN1P20061 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCN1P20061 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCN1P20061 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCN1P20061 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCN1P20061 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCN1P20061 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCN1P20061 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN1P20061 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN1P20061 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN1P20061 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN1P20061 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN1P20061 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN1P20061 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN1P20061 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCN1P20061 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCN1P20061 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCN1P20061 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCN1P20061 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCN1P20061 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCN1P20061 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCN1P20061 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms