Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RPL17P18621 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPL17P18621 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPL17P18621 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL17P18621 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL17P18621 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPL17P18621 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RPL17P18621 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL17P18621 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL17P18621 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL17P18621 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPL17P18621 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL17P18621 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL17P18621 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL17P18621 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPL17P18621 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPL17P18621 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPL17P18621 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPL17P18621 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPL17P18621 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL17P18621 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL17P18621 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL17P18621 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPL17P18621 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL17P18621 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL17P18621 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL17P18621 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL17P18621 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPL17P18621 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL17P18621 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPL17P18621 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPL17P18621 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPL17P18621 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL17P18621 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL17P18621 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL17P18621 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPL17P18621 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPL17P18621 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPL17P18621 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL17P18621 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL17P18621 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL17P18621 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL17P18621 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL17P18621 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL17P18621 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPL17P18621 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPL17P18621 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPL17P18621 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPL17P18621 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPL17P18621 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPL17P18621 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPL17P18621 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPL17P18621 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPL17P18621 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPL17P18621 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPL17P18621 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPL17P18621 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPL17P18621 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPL17P18621 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPL17P18621 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPL17P18621 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPL17P18621 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPL17P18621 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPL17P18621 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPL17P18621 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPL17P18621 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPL17P18621 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPL17P18621 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPL17P18621 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPL17P18621 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPL17P18621 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPL17P18621 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPL17P18621 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPL17P18621 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPL17P18621 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPL17P18621 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPL17P18621 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPL17P18621 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPL17P18621 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RPL17P18621 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPL17P18621 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPL17P18621 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPL17P18621 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPL17P18621 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPL17P18621 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPL17P18621 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL17P18621 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPL17P18621 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPL17P18621 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPL17P18621 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPL17P18621 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms