Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB6P18564 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB6P18564 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB6P18564 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB6P18564 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB6P18564 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms