Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDE6GP18545 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDE6GP18545 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PDE6GP18545 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6GP18545 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDE6GP18545 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms